Klinische Obduktionen nehmen heute nur noch einen relativ kleinen Teil der Arbeit von Patholog:innen ein. Primäres Ziel der klinischen Obduktion ist die endgültige Klärung der Todesursache und die Identifikation zu Lebzeiten möglicherweise nicht erkannter Krankheiten.

Die Ergebnisse der klinischen Obduktion dienen im Austausch mit den Fachärzt:innen auch als Werkzeug der klinischen Qualitätskontrolle, von der zukünftige Patient:innen profitieren können. Für Angehörige verschafft eine Obduktion Gewissheit über die Umstände des Todes beziehungsweise einer Erkrankung. Dies kann möglicherweise zur Abklärung einer Berufserkrankung relevant sein - zum Beispiel nach beruflicher Asbestexposition.